ITK Release 4.12

New Features

  • Wrapping Improvements

 - Enable BridgeNumPy by default with Python wrapping
 - Build support for Microsoft Visual C++ Compiler for Python 2.7
 - BridgeNumpy integrates new pairs of functions. GetArrayViewFromImage() and GetImageViewFromArray() return views on the source object given as a parameter to the function. Memory is shared among input and output objects and the source object still manages pixel buffer memory. The existing functions GetArrayFromImage() and GetImageFromArray() perform a deep copy of the source object.
 - Similar NumPy bridge functions have been created for VNL matrices and VNL vectors.
 - Convenience functions imread() and imwrite() have been added to the Python itk namespace. These functions facilitate respectively reading and writing images using ITK without having to specify the input or output image component type. The naming of these functions follows the convention used in several other Python project such as scikit-learn and scipy.
 - Better integration in Jupyter Notebook: addressed tab completion bug for IPython >= 5.0.0, replaced underscore with ‘x’ to name attributes that start with a digit to show attributes when trying to autocomplete in IPython.
 - Wrap itkN4BiasFieldCorrectionImageFilter, NormalVariateGenerator, and PathToImageFilter.
 - Allows calling ImageFileWriter in Python with an ITK filter as input image argument.
 - Build Python wrapping with hidden visibility

  • New Remote Modules

 - Strain
   - Filters to estimate a strain tensor field from a displacement field or a spatial transformation

  • Core Improvements

 - Enable hidden visibility property with NIFTI and GIFTI static libraries
 - Fix clearing build tree error
 - Add examples and doc build flag support for external modules
 - Support for recent Clang in FreeBSD
 - Improved support for Visual Studio 2017
 - Prefer std::atomic over compiler specific implementation

  • Filtering Improvements

 - Add OrientedBoudingBox attributes to ShapeLabelMap
 - Prefer std::atomic over compiler specific implementation
 - Skip generating export headers if module does not contain a target
 - Introduce ITK_WRAP_PYTHON_LEGACY to exclude older Python package layout
 - Move morphological watersheds out of ITKReview
 - Add SetReferenceImage to GenerateImageSource
 - Reduce memory usage of itkImagePCAShapeModelEstimator
 - Improvement of itkHistogram in order to make it faster
 - Better compatibility with OpenCVImageBridge

  • IO Improvements

 - Improvement of palette image support for PNG, TIFF and BMP

  • Documentation Improvements

 - Updates to the Software Guide, Doxygen, Wiki and Sphinx Examples

  • Remote Module Updates

 - BridgeNumPy updated to latest upstream (04.28.2017)

  • Third Party Library Updates

 - Update SWIG version to 3.0.12
 - Update PCRE version to 8.40
 - MetaIO updated to latest upstream (04.08.2017)
 - KWSys updated to latest upstream (04.20.2017)
 - KWIML updated to latest upstream (02.27.2017)
 - VNL updated to latest upstream (02.01.2017)

  • Improved Code Coverage – we are at 85.7%

 - Jon Haitz-Legarreta's extensive code coverage improvements

Changes from v4.12rc03 to v4.12.0

Bradley Lowekamp (1):

     COMP: Inform Doxygen of ITK_FORCE_EXPORT_MACRO

Francois Budin (2):

     BUG: Remove weak symbol warnings on MacOS in VNL template classes
     BUG: Replace class forward declaration attributes with ITK_FORWARD_EXPORT

Hans Johnson (2):

     COMP: Remove unused boiler plate constants
     COMP:  Incorrect scope resolution for typename

Jared Vicory (1):

     BUG: Fix LBFGS crash when minimum is starting point.

Matthew McCormick (6):

     COMP: Use ITK_TEMPLATE_EXPORT in explicit export forward declarations
     COMP: Suppress global weak symbol warnings for std::vector
     COMP: Linux explicitly instantiated build errors
     BUG: Remove duplicate VectorContainer integer wrapping
     BUG: Remove duplicate ImageSource Covariant Vector wrapping

Vladimir S. FONOV (1):

     MINC 2017-05-28 (002d510c)

Changes from v4.12rc02 to v4.12rc03

Bradley Lowekamp (4):

     BUG: include HDF5 config in ITK config
     BUG: Add fixed seed to registration tests
     ENH: Use scikit-ci-addons for CiricleCI CMake installation and junit
     BUG: Initialized the sampling seed for v3 registration test

Francois Budin (1):

     ENH: Remove 'weak symbol' warning on MacOS

Matthew McCormick (5):

     BUG: itk.ctype does not understand ints without signed
     BUG: Rename to
     DOC: Remove Doxygen note about GDCM version
     BUG: Bump Bridge NumPy to address Windows long sizes
     COMP: Suppress macOS std::string linker visibility warnings

Vladimir S. FONOV (1):

     MINC 2017-05-19 (f6853a70)

Changes from v4.12rc01 to v4.12rc02

Christina Rossmanith (1):

     BUG: calculate levelSetValue for IsoContourFilter with float precision

David T. Chen (1):

     DOC: Fix Pysical Typo

Francois Budin (3):

     BUG: Remove doxygen warnings 'Found unknown command \epsilon'
     ENH: Remove warning messages in GCC 5.1 due to ITK_TEMPLATE_EXPORT
     BUG: GCC 5.1 warnings 'type attributes ignored after type is already defined'

Jon Haitz Legarreta Gorroño (1):

     DOC: Add use note to itkGridForwardWarpImageFilter.

Matthew McCormick (1):

     BUG: Update the Strain remote module to 2017-05-05

Vladimir S. FONOV (3):

     MINC 2017-04-28 (3d79acf3)
     MINC 2017-05-01 (4caf8f4c)
     MINC 2017-05-05 (cc682b52)

Changes from v4.11.0 to v4.12rc01

Ben Boeckel (1):

     ENH: Add a script to help update third-party sources

Brad King (5):

     ENH: Update KWIML import script for new upstream URL
     ENH: Teach update-third-party.bash to add a Change-Id
     ENH: Port KWSys update script to update-third-party.bash
     ENH: KWSys: Filter out unused attributes during import
     ENH: KWSys: Apply attribute changes made upstream

Bradley Lowekamp (19):

     COMP: Enable hidden visibility property with NIFTI static libraries
     COMP: Enable hidden visibility property with GIFTI static libraries
     BUG: Correct variable name used to check CXX version
     BUG: Correct variable name used to check CXX version
     COMP: Enable hidden visibility property with NIFTI static libraries
     COMP: Enable hidden visibility property with GIFTI static libraries
     BUG: Initialize ConvergenceValue in constructor
     BUG: Initialize ConvergenceValue in constructor
     ENH: Update CircleCi script to download latest binary tar-ball
     BUG: Use CMAKE_DL_LIBS instead of explict dl library
     COMP: Fix CircleCI ITK data download file name
     ENH: Update CircleCI yaml file
     BUG: Apply changes from MetaIO upstream to remove static variables
     ENH: Update SWIG version to 3.0.12
     ENH: Update PCRE version to 8.40
     ENH: Add OrientedBoudingBox attributes to ShapeLabelMap
     COMP: Use std::abs over vnl_math_abs
     BUG: Initialize image data to 0
     ENH: Fix clearing build tree error

David T. Chen (1):

     BUG: Fixed quote style

Dženan Zukić (3):

     STYLE: Simplify code by using TestingMacros
     BUG: fixing wrong check for argument count
     ENH: Add Strain as a remote module

Floris Berendsen (2):

     COMP: Added missing png_get_uint_31 name mangling
     COMP: Added missing png_get_uint_31 name mangling

Francois Budin (58):

     STYLE: Typo corrections in itk*TopHatImageFilter.h
     ENH: Prefer std::atomic over compiler specific implementation
     BUG: Addresses 'ordered comparison between pointer and zero' error (clang-4)
     BUG: Addresses InDoxygenGroup Test with Python 3.6 failures
     BUG: BSplineScatteredDataPointSetToImageFilter output image is not generated
     BUG: itk::RGBPixel needs to be wrapped for itkTIFFImageIO
     BUG: Usage of std::atomic was incorrectly used in itk::Detail::AtomicOps
     ENH: Exposing functions to set real and imaginary part of complex numbers
     BUG: ITK_OVERRIDE  keyword for non-overriden funtion
     BUG: 'typename' cannot be used outside of template declaration
     BUG: Missing ITK_OVERRIDE
     BUG: ITK_OVERRIDE  keyword for non-overriden funtion
     BUG: ITK_OVERRIDE  keyword for non-overriden funtion
     BUG: ITK_OVERRIDE  keyword for non-overriden funtion
     BUG: Missing ITK_OVERRIDE
     ENH: Improving usability in IPython
     ENH: Update BridgeNumPy to most recent version (2017.02.24)
     BUG: 3523 Even padding most value representations with space instead of '\0'
     BUG: Remove extra space in chronometer command
     DOC: Make it more explicit that 'push' authorization is not for everybody
     BUG: 3523 Even padding most value representations with space instead of '\0'
     BUG: 3519 KernelTransform WMatrix initialization
     BUG: KWSys symbols should not be exported with WINDOWS_EXPORT_ALL_SYMBOLS
     COMP: Do not expose functions to set real and img part of complex numbers
     BUG: KWSys symbols should not be exported with WINDOWS_EXPORT_ALL_SYMBOLS
     BUG: 3519 KernelTransform WMatrix initialization
     DOC: Typo in itkNumberToString.h
     BUG: Attribute names cannot start with a digit
     BUG: Do not define deprecated function if ITK_LEGACY_REMOVE is selected
     BUG: Wrap EllipseSpatialObject std::list in Python
     ENH: Wrap itkN4BiasFieldCorrectionImageFilter in Python
     BUG: itkStatisticsAlgorithmTest throwing exception on VS2015Update3 and VS2017
     ENH: Skip generating export headers if module does not contain a target
     BUG: Wrapping of itkHessianToObjectnessMeasureImageFilter moved out of Review
     ENH: Update BridgeNumPy to most recent version (2017.03.27)
     BUG: Wrapping of itkHessianToObjectnessMeasureImageFilter moved out of Review
     BUG: Wrap EllipseSpatialObject std::list in Python
     ENH: Improving usability in IPython
     BUG: Attribute names cannot start with a digit
     BUG: Do not export GDCM and Expat symbols with WINDOWS_EXPORT_ALL_SYMBOLS
     BUG: Do not export all symbols from third party libraries on Windows
     ENH: Allows to call ImageFileWriter in Python with Input=Filter
     BUG: Certain third party libraries need to export their symbols on Windows
     BUG: Test if 'issubclass' only if 'isclass' is True
     ENH: Add Python convenience function to read images
     BUG: 3475 AccumulateImageFilter not setting direction cosines of output image
     DOC: Removing typos in itkExtractImageFilter comments
     BUG: ProjectionImageFilter did not copy direction cosine information to output
     BUG: Test if 'issubclass' only if 'isclass' is True
     BUG: 3475 AccumulateImageFilter not setting direction cosines of output image
     BUG: Do not export GDCM and Expat symbols with WINDOWS_EXPORT_ALL_SYMBOLS
     BUG: Do not export all symbols from third party libraries on Windows
     BUG: Certain third party libraries need to export their symbols on Windows
     BUG: ProjectionImageFilter did not copy direction cosine information to output
     ENH: Update BridgeNumPy (2016.04.28) and update accordingly
     BUG: Template type based input function parameter needs to be deterministic
     ENH: Bump CMakeLists.txt version to 4.11.1
     BUG: Problems due to ComputeOrientedBoundingBox in itkShapeLabelMapFilter

Jean-Baptiste VIMORT (1):

     PERF: Improvement of the itkHistogram class in order to make it faster

Jean-Christophe Fillion-Robin (2):

     ENH: Introduce ITK_WRAP_PYTHON_LEGACY to exclude older Python package layout
     BUG: ITKPython: Do not install *.mdx files required only at generation time

Johan Andruejol (1):

     ENH: Add wrapping for PathToImageFilter

Jon Haitz Legarreta (131):

     ENH: Improve the itkFileListVideoIO coverage.
     STYLE: Improve the BSplineScatteredDataPointSetToImageFilter style,
     ENH: Improve the itkBSplineScatteredDataPointSetToImageFilter coverage.
     ENH: Add missing ivars in function PrintSelf.
     STYLE: Improve ImageNoise filters' style.
     STYLE: Improve the ImageNoise filters tests' style.
     STYLE: Improve ITKImageSources module filters' style.
     STYLE: Improve the itkLinearInterpolateImageFunction style.
     ENH: Improve the itkLabelOverlapMeasuresImageFilter coverage.
     STYLE: Improve itkAdaptiveHistogramEqualizationImageFilter style.
     ENH: Improve itkAdaptiveHistogramEqualizationImageFilter coverage.
     STYLE: Improve itkKappaStatisticImageToImageMetric style.
     ENH: Improve the itkKappaStatisticImageToImageMetric coverage.
     STYLE: Improve itkBinaryGrindPeakImageFilter style.
     STYLE: Improve the itkCannyEdgeDetectionImageFilter style.
     ENH: Improve itkCannyEdgeDetectionImageFilter coverage.
     ENH: Improve itkBarrier class coverage.
     STYLE: Improve itkFlipImageFilterStyle.
     STYLE: Improve itkSpatialObjectToPointSetFilter style.
     STYLE: Improve itkStretchIntensityImageFilter style.
     ENH: Print all ivars for itkStretchIntensityImageFilter.
     ENH: Improve itkPhysicalPointImageSource class coverage.
     ENH: Add missing ivars to LabelMapMaskImageFilter PrintSelf.
     ENH: Improve itkRealTimeClock coverage.
     STYLE: Improve the itkRealTimeClock style.
     ENH: Improve itkBsplineDecompositionImageFilter coverage.
     ENH: Improve itkTestingStretchIntensityImageFilter coverage.
     STYLE: Improve itkPathToChainCodePathFilter style.
     ENH: Add a Get method for itkPathToChainCodePathFilter ivar.
     ENH: Add specific testing macro for boolean members.
     STYLE: Improve itkLabelMapMaskImageFilter style.
     STYLE: Improve BSplineDecompositionImageFilter style.
     ENH: Finish itkAdaptiveHistogramEqualizationImageFilter PrintSelf.
     COMP: Fix ImageGrid tests compiler warnings.
     ENH: Finish BSplineDecompositionImageFilter PrintSelf.
     BUG: Fix Uninitialized Memory errors reported by Valgrind.
     ENH: Improve itkLabelMapMaskImageFilter coverage.
     ENH: Improve itkBinaryGrindPeakImageFilter coverage.
     ENH: Improve itkPathToChainCodePathFilter coverage.
     ENH: Move LabelMap module test baselines.
     ENH: Move BinaryMathMorphology test baselines out of review.
     ENH: Move ImageFusion test baselines out of review.
     ENH: Improve itkAutoCropLabelMapFilter tests.
     ENH: Improve itkSpatialObjectToPointSetFilter coverage.
     ENH: Move ImageLabel test baselines out of Review.
     ENH: Move ImageGrid test baselines out of review.
     STYLE: Improve itkGaussianSpatialFunction class' style.
     ENH: Improve the ITKPath module classes coverage.
     BUG: Fix BSplineDecompositionImageFilter Valgrind defects.
     STYLE: Improve itkColorTable style.
     ENH: Improve itkHoughTransform2DLinesImageFilter coverage.
     ENH: Improve itkHoughTransform2DCirclesImageFilter coverage.
     BUG: Address uninitialized variable defects.
     STYLE: Improve itk::HistogramThresholdImageFilter style.
     DOC: Fix a typo in the term threshold.
     STYLE: Imporve itkContourSpatialObjectPoint style.
     ENH: Print all HoughTransform2DLinesImageFilter ivars.
     STYLE: Fix type in Optimizersv4 and Metricsv4 modules.
     ENH: Add PhiLattice regression baseline.
     ENH: Print all itkVoronoiDiagram2DGenerator ivars.
     ENH: Improve itkColorTable coverage.
     ENH: Improve the itk::GradientDescentOptimizerv4 style.
     ENH: Improve the itkImageSources module's filters' coverage.
     ENH: Add PhiLattice regression baseline.
     ENH: Add a new test for itk::ContourSpatialObjectPoint.
     BUG: Fix bug in itkContourSpatialObjectPointTest test.
     STYLE: Improve the itkGaussianSpatialFunctionTest style.
     ENH: Improve itkVotingBinaryHoleFillingImageFilter coverage.
     BUG: Fix precision issues in itkGaborKernelFunctionTest.
     BUG: Relax tolerance in itkGaborKernelFunctionTest.
     DOC: Fix minor typo in itkHistogramThresholdImageFilter doc.
     ENH: Print all ivars in GradientDescentOptimizer base classes.
     STYLE: Improve TIFFImageIO tests.
     ENH: Add Get methods for itk::BSplineDecompositionImageFilter ivars.
     BUG: Fix TimeProbes name in itkLargeTIFFImageWriteReadTest.
     BUG: Fix memory leaks in BMP and PNG tests.
     COMP: Fix signed/unsigned mismatch warning.
     COMP: Fix signed/unsigned mismatch warning.
     BUG: Fix Superclass for ITKThresholding calculators.
     BUG: Make the number of filters be an integer.
     ENH: Honor the itkBooleanMacro for boolean class members.
     ENH: Improve the Watershed module code coverage.
     COMP: Fix double to unsigned int cast warning.
     ENH: Improve coverage for MorphologicalWatersheds filters.
     STYLE: Improve the Denoising module style.
     BUG: Fix the itkPatchBasedDenoisingImageFilter RTTI Superclass name.
     COMP: Fix unsigned char from double conversion warning.
     ENH: Improve itkWatershedMiniPipelineProgressCommand coverage.
     ENH: Improve the itkRegionalMin/Max filters member print types.
     ENH: Improve the itkMorphologicalWatershedFromMarkers coverage.
     ENH: Improve the itkIsolatedWatershedImageFilter coverage.
     STYLE: Improve the Denoisinig module style.
     STYLE: Improve the FEMRegistration module files style.
     DOC: Fix itkOrientImageFilter UseImageDirection method doc typo.
     STYLE: Improve the ITKThresholding module classes style.
     BUG: Fix itkIsolatedWatershedImageFilterTest valgrind errors.
     STYLE: Improve the itkApproximateSignedDistanceMapImageFilter style.
     ENH: Improve Denoising module filters' coverage.
     ENH: Improve the FEMRegistration module coverage.
     STYLE: Improve the itkDisplacementFieldTransform class style.
     STYLE: Limit itkFlipImageFilter methods' loops variables' scope.
     ENH: Improve itkFlipImageFilter coverage.
     COMP: Fix itkPhysicsBasedNonRigidRegistrationMethodTest cast warning.
     STYLE: Improve the HessianToObjectnessMeasureImageFilter style.
     ENH: Improve coverage for HessianToObjectnessMeasureImageFilter.
     ENH: Improve DiscreteGaussianImage operators review classes' coverage.
     ENH: Add test for itk::ConicShellInteriorExteriorSpatialFunction.
     ENH: Print all itkHoughTransform2DCirclesImageFilter ivars.
     ENH: Improve coverage for itk::DisplacementFieldTransform.
     STYLE: Make itkPatchBasedDenoisingBaseImageFilter ivars private.
     STYLE: Improve the itkRobustAutomaticThreshold classes style.
     COMP: Fix itkDisplacementFieldTransformTest compiler warning.
     STYLE: Improve the itkGridForwardWarpImageFilter style.
     ENH: Improve coverage for itkGridForwardWarpImageFilter.
     ENH: Improve coverage for itkRobustAutomaticThreshold classes.
     ENH: Remove duplicate test files in Review.
     DOC: Fix itkDivideByConstantImageFilter doc error.
     STYLE: Improve exception message.
     STYLE: Improve ImageIntensity module image arithm op tests' style.
     STYLE: Improve HConc/Conv HMaxima/HMinima image filters' style.
     ENH: Improve the HConc/HConv HMaxima/HMinima filters' coverage.
     ENH: Improve DiscreteGaussianImage operators review classes' coverage.
     ENH: Change the URL for the PCA remote module repo.
     STYLE: Make flow control variables have a local scope.
     ENH: Add examples and doc build flag support for external modules.
     DOC: Remove wrong group tag for itk::QuadEdgeMeshExtendedTraits.
     BUG: Fix itk::FastMarchingImageFilter RTTI superclass name.
     STYLE: Improve the itk::NodePair class style.
     STYLE: Use the ITK_MANUAL_INSTANTIATION macro consistently.
     STYLE: Delete FastMarching module classes methods consistently.
     DOC: Fix typo in the implementation word across the code.

Jon Haitz Legarreta Gorroño (2):

     STYLE: Improve itkWarpHarmonicEnergyCalculator style.
     DOC: Add a notice to let users know about related implementations.

KWIML Upstream (1):

     KWIML 2017-02-27 (aa3a7733)

KWSys Upstream (3):

     KWSys 2016-11-21 (cb55cf5a)
     KWSys 2017-03-28 (34999b6a)
     KWSys 2017-04-20 (8785f84f)

Matthew McCormick (40):

     COMP: Add missing headers in OpenCVImageBridge
     COMP: Use double for gradient calculations in MinMaxCurvatureFlow
     ENH: Bump ITK version to 4.12.0.
     COMP: Add VCL support for GCC 7
     COMP: Add missing ITK_FALLTHROUGH in TiffImageIO
     COMP: Avoid -Warray-bounds in FixedArray with GCC 7
     COMP: Add ProcessObject include in itkLevelSetBase.hxx
     ENH: Exclude Kitware Robot from third party update commit messages
     BUG: Address tab completion with IPython >= 5.0.0
     BUG: Do not use terminal_progress with the Jupyter Notebook
     ENH: Enable BridgeNumPy with Python wrapping
     COMP: Do not require numeric_traits::has_infinity
     BUG: Fix passing _NO_TR1 definition with VS9 and Python
     BUG: Do not tests that require NumPy when it is not available
     ENH: Build Python wrapping with hidden visibility
     ENH: Move morphological watersheds out of ITKReview
     BUG: Do not upload top level folder in
     BUG: Remove unused content links from PNG test additions
     ENH: Add .sha512 content links for IO pallette test data
     BUG: Add missing export macros for SpatialObject forward declarations
     BUG: Always wrap basic type RGBUC
     COMP: Do not add Visual Studio numeric_traits workarounds with MinGWPy
     COMP: Increase gold linker requirement to GCC 4.9.0
     COMP: Detect Windows with _WIN32 in socket++/fork.cpp
     BUG: Revert BUG:`` ``Include`` ``installed`` ``modules`` ``in`` ``ITK_MODULES_ENABLED
     BUG: Set ${itk-module}_ENABLE_SHARED in ITKModuleExternal
     BUG: PolyLineParametricPath must be loaded before PathToImageFilter
     COMP: Address Python 2.7 Windows _hypot build errors
     COMP: Undefine Py_hash_t when wrapping VtkGlue
     ENH: Update BridgeNumPy to most recent version (2017.03.05)
     BUG: Improve itkTemplate New compatibility with Python 3
     ENH: Bump CastXML to 2017-04-18
     STYLE: Remove empty or erroreous comments in ImageToImageFilter
     ENH: Use itk.imread and itk.imwrite as standard function names
     BUG: Correct size specification in ImportImageFilter::SetImportPointer
     BUG: Improve large file support in MetaIO
     ENH: Wrap itk::IdentifierType for ScalarToRGBColormapImageFilter
     BUG: LevelSetNeighborhoodExtractor uses spacing
     BUG: Fix PCRE 8.40 download URL

MetaIO Maintainers (1):

     MetaIO 2017-04-08 (dead6687)

Olivier Commowick (1):

     BUG: Correct ITK eigen system (was producing NaN or different values than VNL)

Pablo Hernandez-Cerdan (4):

     ENH: Add SetReferenceImage to GenerateImageSource.
     ENH: Change the metadata of all outputs in GenerateImageSource.
     BUG: Fix Normalization kernel step of ConvolutionImageFilter.
     BUG: Remove call to Superclass::GenerateOutputInformation.

Richard Beare (1):

     DOC: PrincipleComponent flag incorrectly reported by PrintSelf

Sam Horvath (1):

     PERF: reduce memory usage of itkImagePCAShapeModelEstimator

Samuel Gerber (2):

     DOC: Added description to itkLBFGSOptimizerv4.h
     DOC: LBFGSOptimizer doc update

Shusil Dangi (2):

     ENH: Ignores MacOS .DS_Store file
     ENH: Wrap NormalVariateGenerator in the Statistics Module

Simon Rit (2):

     BUG: memory leak in ITK_USE_THREADPOOL
     BUG: Join threads when using thread pool (ITK_USE_THREADPOOL)

Taylor Braun-Jones (1):

     COMP: Only include the headers for required OpenCV modules (fixup)

VXL Maintainers (2):

     VNL 2017-02-01 (ae6eff5e)
     VNL 2017-02-08 (ae8eef13)

Yann Le Poul (4):

     ENH: improvement of palette image support for PNG TIFF and BMP.
     STYLE: Misleading IsReadAsScalarPlusPalette Printing string
     STYLE: ReadAsScalarPlusPalette info already printed in itkImageIOBase
     BUG: ExpandRGBPalette used instead of IsReadAsScalarPlusPalette

ITK Sphinx Examples Changes

Beatriz Paniagua (1):

     ENH: Add FlipImageFilter

Dženan Zukić (3):

     BUG: fixing misspelled directory name
     ENH: translating ImageReadExtractFilterInsertWrite into Python
     ENH: updating TODO list with recent patches

Francois Budin (4):

     BUG: Reducing Windows path length was not consistent
     ENH: Import data into an ITK Image
     BUG: Move FlipImageFilter from src/Core/Common to src/Filtering/ImageGrid

Maeliss Jallais (1):

     ENH: Add ReadWriteVectorImage

Matt McCormick (32):

     BUG: Clean up ObserveAnEvent
     ENH: Add .sha512 content links
     ENH: Remove .md5 content links
     ENH: Update ExternalData_URL_TEMPLATES for sha512 resources
     ENH: Update the ITKExamples scripts to use the .sha512 content links
     ENH: Update CMake/ExternalData.cmake
     ENH: Remove Utilities/
     ENH: Remove Utilities/
     ENH: Remove pydas and related submodules
     ENH: Bump ITK to 2017-03-06 master
     ENH: Use GitHub for faster ITK repository downloads
     DOC: Update UploadBinaryData.rst
     DOC: Tweak content link usage with girder-cli
     DOC: Remove ContributeWithWebInterface.rst
     DOC: Swap WriteANewExample / ContributeWithGit order
     ENH: Do not build the Python wrapping in the Superbuild
     ENH: Enable ITKExamples_USE_WRAP_PYTHON by default
     ENH: Create itkpython virtualenv on Mac and Linux
     STYLE: Do not uses spaces after/before brackets in CMakeLists.txt
     ENH: Add the superbuild itkpython binary folder to FindSphinx
     BUG: outputs template
     ENH: Download itkpython in the Windows superbuild
     DOC: Recommend cloning into a short directory on Windows
     ENH: Reduce Windows superbuild path length requirements
     BUG: Fix BoundingBoxOfAPointSetTestPython on Windows
     ENH: Add example image filenames in template figure directive
     ENH: Add Create An Image example
     BUG: CreateAImageRegion -> CreateAnImageRegion
     BUG: Fix CreateAnImageRegion output regex matching
     STYLE: Address spacing in CreateAnImage
     BUG: Update the Python package URL, nightly to latest
     DOC: How to run a Python example

Max Smolens (5):

     BUG: Fix errors in generated
     ENH: Remove CannyEdgeDetectionImageFilter TODO items
     ENH: Add itk.RGBToLuminanceImageFilter Python example
     DOC: Fix typo in contribution documentation
     ENH: Add WarpImageFilter example

Neal Siekierski (1):

     ENH: Add example of itk::Statistics::Histogram creation and access

Sam Horvath (2):

     ENH: Add CreateAnImageOfVectors
     ENH: Add BlurringAnImageUsingABinomialKernel

ITK Software Guide Changes

Jon Haitz Legarreta (1):

     DOC: Add testing section to SW guide.

Matt McCormick (6):

     DOC: Document itk_module_add_library
     DOC: Modules without a src/ directory should not set ENABLE_SHARED
     Merge DOC:`` ``Add`` ``testing`` ``section`` ``to`` ``SW`` ``guide.
     DOC: Update the Kitware BrainWeb data link
     BUG: Escape hash in Girder URL
     DOC: Add Python package installation instructions